Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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