Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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