Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMSAP2Q08AD1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMSAP2Q08AD1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms