Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
POLEQ07864 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
POLEQ07864 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms