Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms