Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms