Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NRG1Q02297 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NRG1Q02297 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms