Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MC1RQ01726 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms