Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms