Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms