Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKL1Q00532 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKL1Q00532 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms