Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRX1P78414 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRX1P78414 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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