Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P62684 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms