Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HERVK_113P61574 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms