Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ABCE1P61221 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms