Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BACE1P56817 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms