Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEMP55040 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEMP55040 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms