Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCA2P51587 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms