Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUFMP49411 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUFMP49411 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUFMP49411 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUFMP49411 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUFMP49411 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUFMP49411 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUFMP49411 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUFMP49411 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUFMP49411 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUFMP49411 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUFMP49411 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms