Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPIAP49247 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPIAP49247 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPIAP49247 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPIAP49247 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms