Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GGCXP38435 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms