Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms