Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOX11P35716 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOX11P35716 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SOX11P35716 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOX11P35716 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SOX11P35716 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SOX11P35716 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOX11P35716 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SOX11P35716 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SOX11P35716 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SOX11P35716 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOX11P35716 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms