Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms