Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NTF4P34130 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NTF4P34130 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NTF4P34130 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NTF4P34130 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NTF4P34130 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NTF4P34130 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NTF4P34130 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms