Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA13P31271 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms