Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms