Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNGA1P29973 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNGA1P29973 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNGA1P29973 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNGA1P29973 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms