Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms