Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms