Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2AP24928 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.1 ms