Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PTPREP23469 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPREP23469 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPREP23469 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPREP23469 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPREP23469 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPREP23469 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPREP23469 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPREP23469 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPREP23469 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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