Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms