Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VCLP18206 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VCLP18206 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VCLP18206 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms