Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RALAP11233 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RALAP11233 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RALAP11233 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RALAP11233 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RALAP11233 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RALAP11233 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RALAP11233 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RALAP11233 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RALAP11233 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RALAP11233 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RALAP11233 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RALAP11233 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RALAP11233 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RALAP11233 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RALAP11233 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RALAP11233 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RALAP11233 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RALAP11233 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms