Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PRB1P04280 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PRB1P04280 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms