Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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