Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPP2O95045 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UPP2O95045 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UPP2O95045 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UPP2O95045 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms