Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CEP104O60308 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP104O60308 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms