Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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