Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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