Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms