Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
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