Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms