Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms