Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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