Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms