Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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RAB9BQ9NP90 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RAB9BQ9NP90 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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