Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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