Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC46A2Q9BY10 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms